Histamin je podražajni neurotransmiter uključen u ciklus spavanja / buđenja i upalnog odgovora. Ovisno o receptoru, histamin aktivira široku lepezu bioloških djelovanja, koja se može pojaviti. Na primjer, jedan receptor pomaže regulirati ciklus spavanja / buđenja, dok drugi receptor pomaže regulirati otpuštanje norepinefrina, serotonina i acetilkolina. Postoje i drugi receptori koji mogu biti aktivirani kako bi se inducirao upalni odgovor, a koji su obično povezani s izlaganjem alergenu.
Zanimljivo, utvrđeno je da neuroni koji sadrže histamin imaju funkciju elektrostimulatora srca u mozgu. Stope otpuštanja tih neurona koreliraju pozitivno s razinom aktivnosti mozga i prikazuju određeni dnevno - noćni ritam. U stražnjem području hipotalamusa, postoji veliki broj neurona koji sintetiziraju i koriste histamin. Ovi neuroni pružaju stimulaciju, koja održava ili modulira aktivnost u mnogim drugim područjima mozga.